Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SMAD3P84022 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMAD3P84022 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMAD3P84022 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMAD3P84022 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMAD3P84022 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMAD3P84022 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMAD3P84022 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMAD3P84022 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMAD3P84022 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMAD3P84022 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMAD3P84022 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMAD3P84022 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMAD3P84022 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMAD3P84022 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMAD3P84022 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMAD3P84022 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SMAD3P84022 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SMAD3P84022 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMAD3P84022 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMAD3P84022 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMAD3P84022 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMAD3P84022 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMAD3P84022 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMAD3P84022 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMAD3P84022 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMAD3P84022 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SMAD3P84022 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMAD3P84022 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMAD3P84022 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SMAD3P84022 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMAD3P84022 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms