Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRPAP78324 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRPAP78324 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRPAP78324 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRPAP78324 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPAP78324 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRPAP78324 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRPAP78324 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRPAP78324 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIRPAP78324 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRPAP78324 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRPAP78324 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRPAP78324 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRPAP78324 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms