Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAMP2P63027 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAMP2P63027 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP2P63027 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP2P63027 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP2P63027 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP2P63027 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP2P63027 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAMP2P63027 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms