Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCAF7P61962 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF7P61962 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF7P61962 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF7P61962 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF7P61962 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF7P61962 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF7P61962 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF7P61962 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF7P61962 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF7P61962 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF7P61962 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF7P61962 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF7P61962 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF7P61962 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF7P61962 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF7P61962 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF7P61962 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF7P61962 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF7P61962 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF7P61962 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF7P61962 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF7P61962 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF7P61962 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF7P61962 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF7P61962 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms