Protein–RNA interactions for Protein: P61619

SEC61A1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61A1P61619 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC61A1P61619 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC61A1P61619 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC61A1P61619 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC61A1P61619 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC61A1P61619 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC61A1P61619 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC61A1P61619 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC61A1P61619 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC61A1P61619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC61A1P61619 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC61A1P61619 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC61A1P61619 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC61A1P61619 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC61A1P61619 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC61A1P61619 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC61A1P61619 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC61A1P61619 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC61A1P61619 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A1P61619 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms