Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX8P57073 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX8P57073 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX8P57073 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX8P57073 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX8P57073 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SOX8P57073 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SOX8P57073 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX8P57073 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX8P57073 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX8P57073 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX8P57073 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX8P57073 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX8P57073 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX8P57073 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX8P57073 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX8P57073 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX8P57073 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX8P57073 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX8P57073 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX8P57073 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX8P57073 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX8P57073 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX8P57073 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX8P57073 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX8P57073 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX8P57073 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX8P57073 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX8P57073 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX8P57073 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX8P57073 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX8P57073 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX8P57073 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX8P57073 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX8P57073 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX8P57073 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX8P57073 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX8P57073 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX8P57073 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX8P57073 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX8P57073 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX8P57073 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX8P57073 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX8P57073 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX8P57073 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX8P57073 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX8P57073 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX8P57073 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX8P57073 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX8P57073 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX8P57073 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX8P57073 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX8P57073 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX8P57073 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX8P57073 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX8P57073 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX8P57073 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX8P57073 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX8P57073 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX8P57073 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX8P57073 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX8P57073 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX8P57073 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX8P57073 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX8P57073 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX8P57073 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX8P57073 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX8P57073 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX8P57073 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX8P57073 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX8P57073 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX8P57073 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX8P57073 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX8P57073 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX8P57073 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX8P57073 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX8P57073 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX8P57073 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX8P57073 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX8P57073 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX8P57073 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX8P57073 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX8P57073 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX8P57073 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX8P57073 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX8P57073 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX8P57073 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX8P57073 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX8P57073 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX8P57073 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX8P57073 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX8P57073 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX8P57073 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX8P57073 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX8P57073 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX8P57073 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX8P57073 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX8P57073 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX8P57073 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX8P57073 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms