Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME5P56597 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NME5P56597 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME5P56597 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME5P56597 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME5P56597 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME5P56597 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME5P56597 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME5P56597 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME5P56597 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME5P56597 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME5P56597 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME5P56597 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME5P56597 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME5P56597 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME5P56597 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME5P56597 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME5P56597 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME5P56597 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME5P56597 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME5P56597 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME5P56597 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME5P56597 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME5P56597 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME5P56597 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME5P56597 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME5P56597 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME5P56597 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME5P56597 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME5P56597 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME5P56597 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NME5P56597 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NME5P56597 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME5P56597 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME5P56597 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NME5P56597 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME5P56597 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NME5P56597 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME5P56597 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME5P56597 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME5P56597 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME5P56597 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME5P56597 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME5P56597 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME5P56597 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NME5P56597 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME5P56597 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME5P56597 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NME5P56597 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME5P56597 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME5P56597 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME5P56597 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME5P56597 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME5P56597 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME5P56597 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME5P56597 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME5P56597 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME5P56597 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NME5P56597 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME5P56597 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME5P56597 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME5P56597 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME5P56597 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME5P56597 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME5P56597 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME5P56597 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME5P56597 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME5P56597 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME5P56597 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME5P56597 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME5P56597 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME5P56597 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME5P56597 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NME5P56597 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NME5P56597 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NME5P56597 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NME5P56597 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NME5P56597 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NME5P56597 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NME5P56597 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NME5P56597 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NME5P56597 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NME5P56597 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NME5P56597 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME5P56597 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME5P56597 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME5P56597 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME5P56597 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME5P56597 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME5P56597 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME5P56597 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME5P56597 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME5P56597 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME5P56597 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NME5P56597 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME5P56597 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME5P56597 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME5P56597 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NME5P56597 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NME5P56597 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms