Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL4CP56559 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARL4CP56559 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARL4CP56559 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARL4CP56559 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARL4CP56559 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL4CP56559 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARL4CP56559 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARL4CP56559 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL4CP56559 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL4CP56559 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARL4CP56559 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL4CP56559 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL4CP56559 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARL4CP56559 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL4CP56559 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARL4CP56559 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARL4CP56559 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARL4CP56559 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARL4CP56559 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARL4CP56559 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARL4CP56559 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARL4CP56559 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARL4CP56559 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARL4CP56559 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARL4CP56559 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARL4CP56559 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARL4CP56559 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARL4CP56559 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARL4CP56559 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARL4CP56559 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARL4CP56559 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms