Protein–RNA interactions for Protein: P56537

EIF6, Eukaryotic translation initiation factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF6P56537 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EIF6P56537 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
EIF6P56537 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
EIF6P56537 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
EIF6P56537 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EIF6P56537 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
EIF6P56537 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EIF6P56537 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EIF6P56537 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EIF6P56537 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EIF6P56537 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF6P56537 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF6P56537 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF6P56537 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF6P56537 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF6P56537 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EIF6P56537 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EIF6P56537 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EIF6P56537 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
EIF6P56537 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EIF6P56537 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF6P56537 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF6P56537 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EIF6P56537 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EIF6P56537 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF6P56537 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EIF6P56537 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF6P56537 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF6P56537 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF6P56537 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EIF6P56537 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
EIF6P56537 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF6P56537 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF6P56537 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF6P56537 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF6P56537 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EIF6P56537 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF6P56537 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF6P56537 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF6P56537 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EIF6P56537 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EIF6P56537 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
EIF6P56537 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EIF6P56537 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF6P56537 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF6P56537 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF6P56537 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF6P56537 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EIF6P56537 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EIF6P56537 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
EIF6P56537 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EIF6P56537 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EIF6P56537 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
EIF6P56537 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
EIF6P56537 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
EIF6P56537 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
EIF6P56537 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
EIF6P56537 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
EIF6P56537 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EIF6P56537 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EIF6P56537 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
EIF6P56537 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
EIF6P56537 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
EIF6P56537 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
EIF6P56537 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
EIF6P56537 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
EIF6P56537 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EIF6P56537 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
EIF6P56537 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
EIF6P56537 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
EIF6P56537 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
EIF6P56537 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
EIF6P56537 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
EIF6P56537 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
EIF6P56537 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
EIF6P56537 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EIF6P56537 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
EIF6P56537 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
EIF6P56537 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EIF6P56537 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
EIF6P56537 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EIF6P56537 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EIF6P56537 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EIF6P56537 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
EIF6P56537 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EIF6P56537 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EIF6P56537 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EIF6P56537 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
EIF6P56537 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
EIF6P56537 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
EIF6P56537 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EIF6P56537 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EIF6P56537 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EIF6P56537 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EIF6P56537 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EIF6P56537 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EIF6P56537 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF6P56537 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EIF6P56537 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EIF6P56537 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms