Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OXCT1P55809 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OXCT1P55809 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OXCT1P55809 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OXCT1P55809 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OXCT1P55809 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OXCT1P55809 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OXCT1P55809 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
OXCT1P55809 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
OXCT1P55809 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OXCT1P55809 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OXCT1P55809 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OXCT1P55809 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
OXCT1P55809 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms