Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA2D1P54289 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA2D1P54289 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA2D1P54289 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA2D1P54289 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D1P54289 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D1P54289 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA2D1P54289 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA2D1P54289 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA2D1P54289 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA2D1P54289 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA2D1P54289 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA2D1P54289 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA2D1P54289 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D1P54289 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D1P54289 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D1P54289 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D1P54289 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms