Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CACNB3P54284 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNB3P54284 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CACNB3P54284 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CACNB3P54284 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CACNB3P54284 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CACNB3P54284 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CACNB3P54284 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNB3P54284 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNB3P54284 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNB3P54284 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CACNB3P54284 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNB3P54284 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNB3P54284 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNB3P54284 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CACNB3P54284 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CACNB3P54284 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CACNB3P54284 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CACNB3P54284 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CACNB3P54284 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CACNB3P54284 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CACNB3P54284 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CACNB3P54284 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CACNB3P54284 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CACNB3P54284 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CACNB3P54284 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CACNB3P54284 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CACNB3P54284 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CACNB3P54284 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CACNB3P54284 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CACNB3P54284 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CACNB3P54284 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CACNB3P54284 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CACNB3P54284 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNB3P54284 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CACNB3P54284 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CACNB3P54284 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CACNB3P54284 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CACNB3P54284 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNB3P54284 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms