Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATXN3P54252 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATXN3P54252 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATXN3P54252 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN3P54252 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN3P54252 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN3P54252 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN3P54252 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATXN3P54252 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN3P54252 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN3P54252 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN3P54252 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN3P54252 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN3P54252 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN3P54252 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN3P54252 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN3P54252 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms