Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HK3P52790 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HK3P52790 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HK3P52790 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HK3P52790 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HK3P52790 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HK3P52790 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HK3P52790 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HK3P52790 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HK3P52790 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HK3P52790 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HK3P52790 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HK3P52790 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HK3P52790 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HK3P52790 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HK3P52790 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HK3P52790 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HK3P52790 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HK3P52790 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HK3P52790 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HK3P52790 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HK3P52790 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HK3P52790 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HK3P52790 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HK3P52790 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HK3P52790 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HK3P52790 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HK3P52790 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HK3P52790 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HK3P52790 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HK3P52790 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HK3P52790 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HK3P52790 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HK3P52790 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HK3P52790 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HK3P52790 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HK3P52790 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HK3P52790 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HK3P52790 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HK3P52790 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HK3P52790 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HK3P52790 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HK3P52790 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HK3P52790 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HK3P52790 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HK3P52790 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HK3P52790 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HK3P52790 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HK3P52790 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HK3P52790 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HK3P52790 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HK3P52790 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HK3P52790 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HK3P52790 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HK3P52790 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HK3P52790 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HK3P52790 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HK3P52790 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HK3P52790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HK3P52790 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HK3P52790 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HK3P52790 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HK3P52790 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HK3P52790 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HK3P52790 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HK3P52790 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HK3P52790 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HK3P52790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HK3P52790 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HK3P52790 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HK3P52790 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HK3P52790 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HK3P52790 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HK3P52790 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HK3P52790 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HK3P52790 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HK3P52790 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HK3P52790 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HK3P52790 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HK3P52790 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HK3P52790 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HK3P52790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HK3P52790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HK3P52790 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HK3P52790 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HK3P52790 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HK3P52790 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HK3P52790 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HK3P52790 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HK3P52790 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HK3P52790 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HK3P52790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HK3P52790 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HK3P52790 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HK3P52790 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HK3P52790 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HK3P52790 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HK3P52790 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HK3P52790 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HK3P52790 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms