Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2E1P51965 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2E1P51965 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E1P51965 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E1P51965 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2E1P51965 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E1P51965 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E1P51965 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E1P51965 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms