Protein–RNA interactions for Protein: P51149

RAB7A, Ras-related protein Rab-7a, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7AP51149 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB7AP51149 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB7AP51149 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB7AP51149 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB7AP51149 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB7AP51149 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB7AP51149 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7AP51149 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB7AP51149 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB7AP51149 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB7AP51149 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7AP51149 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB7AP51149 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB7AP51149 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms