Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK9P50750 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK9P50750 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK9P50750 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK9P50750 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK9P50750 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK9P50750 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK9P50750 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK9P50750 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK9P50750 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK9P50750 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK9P50750 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK9P50750 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK9P50750 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK9P50750 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK9P50750 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK9P50750 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK9P50750 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK9P50750 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK9P50750 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK9P50750 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK9P50750 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK9P50750 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK9P50750 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK9P50750 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK9P50750 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK9P50750 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK9P50750 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK9P50750 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK9P50750 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK9P50750 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK9P50750 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK9P50750 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK9P50750 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK9P50750 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK9P50750 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK9P50750 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK9P50750 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK9P50750 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK9P50750 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK9P50750 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK9P50750 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK9P50750 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK9P50750 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK9P50750 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK9P50750 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK9P50750 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK9P50750 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK9P50750 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK9P50750 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK9P50750 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK9P50750 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK9P50750 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK9P50750 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK9P50750 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK9P50750 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK9P50750 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK9P50750 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK9P50750 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK9P50750 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK9P50750 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK9P50750 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK9P50750 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK9P50750 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK9P50750 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK9P50750 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK9P50750 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK9P50750 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK9P50750 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK9P50750 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK9P50750 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK9P50750 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK9P50750 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK9P50750 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK9P50750 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK9P50750 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK9P50750 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK9P50750 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK9P50750 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK9P50750 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK9P50750 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK9P50750 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK9P50750 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK9P50750 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK9P50750 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK9P50750 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK9P50750 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK9P50750 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK9P50750 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK9P50750 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK9P50750 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK9P50750 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK9P50750 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK9P50750 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK9P50750 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK9P50750 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK9P50750 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK9P50750 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK9P50750 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK9P50750 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms