Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPAP49450 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPAP49450 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPAP49450 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPAP49450 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPAP49450 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPAP49450 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPAP49450 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPAP49450 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPAP49450 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPAP49450 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPAP49450 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPAP49450 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPAP49450 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPAP49450 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPAP49450 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPAP49450 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPAP49450 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPAP49450 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPAP49450 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPAP49450 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPAP49450 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPAP49450 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPAP49450 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPAP49450 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPAP49450 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPAP49450 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPAP49450 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPAP49450 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPAP49450 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPAP49450 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPAP49450 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPAP49450 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPAP49450 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPAP49450 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPAP49450 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPAP49450 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPAP49450 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPAP49450 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPAP49450 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPAP49450 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPAP49450 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPAP49450 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPAP49450 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPAP49450 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPAP49450 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPAP49450 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPAP49450 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPAP49450 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPAP49450 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPAP49450 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPAP49450 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPAP49450 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPAP49450 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPAP49450 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPAP49450 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPAP49450 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPAP49450 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPAP49450 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPAP49450 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPAP49450 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPAP49450 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPAP49450 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPAP49450 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPAP49450 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPAP49450 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPAP49450 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPAP49450 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPAP49450 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPAP49450 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPAP49450 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPAP49450 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPAP49450 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPAP49450 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPAP49450 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPAP49450 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPAP49450 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPAP49450 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPAP49450 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPAP49450 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPAP49450 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPAP49450 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPAP49450 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPAP49450 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPAP49450 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPAP49450 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPAP49450 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPAP49450 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPAP49450 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPAP49450 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPAP49450 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPAP49450 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPAP49450 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPAP49450 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPAP49450 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPAP49450 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPAP49450 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPAP49450 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPAP49450 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPAP49450 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms