Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC4A3P48751 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLC4A3P48751 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC4A3P48751 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC4A3P48751 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC4A3P48751 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLC4A3P48751 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLC4A3P48751 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC4A3P48751 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A3P48751 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC4A3P48751 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC4A3P48751 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SLC4A3P48751 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC4A3P48751 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC4A3P48751 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SLC4A3P48751 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SLC4A3P48751 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC4A3P48751 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC4A3P48751 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SLC4A3P48751 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLC4A3P48751 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SLC4A3P48751 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC4A3P48751 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC4A3P48751 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SLC4A3P48751 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLC4A3P48751 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms