Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRGP48443 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRGP48443 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRGP48443 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRGP48443 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRGP48443 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRGP48443 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRGP48443 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRGP48443 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRGP48443 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRGP48443 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRGP48443 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRGP48443 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRGP48443 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRGP48443 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRGP48443 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRGP48443 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRGP48443 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRGP48443 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRGP48443 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRGP48443 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRGP48443 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRGP48443 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRGP48443 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRGP48443 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRGP48443 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRGP48443 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRGP48443 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRGP48443 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RXRGP48443 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RXRGP48443 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXRGP48443 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXRGP48443 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RXRGP48443 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRGP48443 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRGP48443 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRGP48443 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRGP48443 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RXRGP48443 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXRGP48443 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRGP48443 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRGP48443 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRGP48443 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRGP48443 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRGP48443 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRGP48443 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRGP48443 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRGP48443 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRGP48443 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRGP48443 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRGP48443 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRGP48443 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRGP48443 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRGP48443 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRGP48443 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXRGP48443 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRGP48443 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRGP48443 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RXRGP48443 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RXRGP48443 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RXRGP48443 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RXRGP48443 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RXRGP48443 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRGP48443 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRGP48443 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRGP48443 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRGP48443 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRGP48443 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRGP48443 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRGP48443 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRGP48443 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRGP48443 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRGP48443 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRGP48443 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRGP48443 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRGP48443 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRGP48443 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRGP48443 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRGP48443 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRGP48443 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRGP48443 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRGP48443 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRGP48443 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRGP48443 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRGP48443 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRGP48443 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRGP48443 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRGP48443 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRGP48443 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRGP48443 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRGP48443 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRGP48443 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRGP48443 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRGP48443 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRGP48443 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRGP48443 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRGP48443 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRGP48443 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRGP48443 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRGP48443 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms