Protein–RNA interactions for Protein: P47712

PLA2G4A, Cytosolic phospholipase A2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4AP47712 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLA2G4AP47712 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLA2G4AP47712 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLA2G4AP47712 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLA2G4AP47712 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLA2G4AP47712 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PLA2G4AP47712 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLA2G4AP47712 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLA2G4AP47712 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLA2G4AP47712 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLA2G4AP47712 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PLA2G4AP47712 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLA2G4AP47712 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLA2G4AP47712 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLA2G4AP47712 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLA2G4AP47712 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLA2G4AP47712 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLA2G4AP47712 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLA2G4AP47712 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLA2G4AP47712 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLA2G4AP47712 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLA2G4AP47712 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLA2G4AP47712 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLA2G4AP47712 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PLA2G4AP47712 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLA2G4AP47712 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLA2G4AP47712 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms