Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP2P46087 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP2P46087 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP2P46087 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NOP2P46087 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NOP2P46087 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP2P46087 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP2P46087 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP2P46087 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP2P46087 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP2P46087 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NOP2P46087 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP2P46087 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP2P46087 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP2P46087 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP2P46087 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP2P46087 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP2P46087 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOP2P46087 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP2P46087 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP2P46087 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP2P46087 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP2P46087 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP2P46087 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP2P46087 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP2P46087 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP2P46087 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP2P46087 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP2P46087 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NOP2P46087 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP2P46087 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP2P46087 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP2P46087 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP2P46087 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP2P46087 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP2P46087 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP2P46087 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP2P46087 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP2P46087 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP2P46087 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP2P46087 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP2P46087 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP2P46087 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP2P46087 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP2P46087 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP2P46087 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP2P46087 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP2P46087 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP2P46087 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP2P46087 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOP2P46087 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOP2P46087 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NOP2P46087 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP2P46087 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP2P46087 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP2P46087 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP2P46087 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOP2P46087 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP2P46087 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP2P46087 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP2P46087 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP2P46087 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOP2P46087 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP2P46087 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP2P46087 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP2P46087 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOP2P46087 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP2P46087 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP2P46087 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP2P46087 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP2P46087 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP2P46087 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP2P46087 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP2P46087 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOP2P46087 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP2P46087 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP2P46087 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP2P46087 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP2P46087 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP2P46087 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP2P46087 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP2P46087 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP2P46087 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOP2P46087 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOP2P46087 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOP2P46087 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOP2P46087 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP2P46087 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP2P46087 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP2P46087 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP2P46087 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP2P46087 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP2P46087 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP2P46087 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP2P46087 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP2P46087 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP2P46087 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP2P46087 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP2P46087 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP2P46087 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms