Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTGER2P43116 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTGER2P43116 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTGER2P43116 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTGER2P43116 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTGER2P43116 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTGER2P43116 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTGER2P43116 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTGER2P43116 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PTGER2P43116 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PTGER2P43116 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTGER2P43116 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTGER2P43116 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTGER2P43116 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PTGER2P43116 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTGER2P43116 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTGER2P43116 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTGER2P43116 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTGER2P43116 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTGER2P43116 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PTGER2P43116 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTGER2P43116 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PTGER2P43116 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTGER2P43116 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTGER2P43116 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTGER2P43116 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTGER2P43116 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTGER2P43116 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTGER2P43116 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTGER2P43116 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTGER2P43116 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTGER2P43116 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTGER2P43116 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTGER2P43116 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTGER2P43116 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTGER2P43116 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTGER2P43116 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTGER2P43116 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTGER2P43116 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTGER2P43116 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTGER2P43116 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTGER2P43116 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTGER2P43116 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTGER2P43116 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTGER2P43116 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTGER2P43116 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTGER2P43116 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTGER2P43116 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms