Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP3P42574 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP3P42574 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP3P42574 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP3P42574 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP3P42574 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP3P42574 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP3P42574 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP3P42574 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP3P42574 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP3P42574 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP3P42574 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP3P42574 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP3P42574 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP3P42574 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP3P42574 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP3P42574 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP3P42574 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP3P42574 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP3P42574 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP3P42574 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP3P42574 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP3P42574 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP3P42574 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP3P42574 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP3P42574 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP3P42574 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP3P42574 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASP3P42574 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP3P42574 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP3P42574 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP3P42574 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP3P42574 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP3P42574 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP3P42574 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP3P42574 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP3P42574 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP3P42574 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP3P42574 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP3P42574 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP3P42574 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP3P42574 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP3P42574 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP3P42574 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP3P42574 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP3P42574 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP3P42574 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP3P42574 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP3P42574 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP3P42574 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP3P42574 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP3P42574 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP3P42574 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP3P42574 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP3P42574 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP3P42574 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP3P42574 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP3P42574 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP3P42574 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP3P42574 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP3P42574 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP3P42574 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP3P42574 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP3P42574 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP3P42574 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP3P42574 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP3P42574 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP3P42574 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP3P42574 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP3P42574 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP3P42574 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP3P42574 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP3P42574 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP3P42574 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP3P42574 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP3P42574 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP3P42574 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP3P42574 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP3P42574 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP3P42574 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP3P42574 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP3P42574 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP3P42574 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP3P42574 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP3P42574 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP3P42574 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP3P42574 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP3P42574 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP3P42574 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP3P42574 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP3P42574 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP3P42574 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP3P42574 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP3P42574 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP3P42574 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP3P42574 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP3P42574 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP3P42574 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP3P42574 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP3P42574 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms