Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTRLP40313 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTRLP40313 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTRLP40313 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTRLP40313 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTRLP40313 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTRLP40313 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTRLP40313 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTRLP40313 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTRLP40313 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTRLP40313 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTRLP40313 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTRLP40313 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTRLP40313 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTRLP40313 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTRLP40313 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTRLP40313 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTRLP40313 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTRLP40313 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTRLP40313 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTRLP40313 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTRLP40313 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTRLP40313 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTRLP40313 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTRLP40313 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTRLP40313 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTRLP40313 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTRLP40313 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTRLP40313 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTRLP40313 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTRLP40313 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTRLP40313 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTRLP40313 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTRLP40313 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRLP40313 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRLP40313 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTRLP40313 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTRLP40313 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRLP40313 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRLP40313 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRLP40313 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRLP40313 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRLP40313 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRLP40313 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRLP40313 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRLP40313 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRLP40313 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRLP40313 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRLP40313 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRLP40313 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRLP40313 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTRLP40313 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTRLP40313 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTRLP40313 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTRLP40313 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRLP40313 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRLP40313 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRLP40313 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRLP40313 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTRLP40313 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTRLP40313 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTRLP40313 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRLP40313 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRLP40313 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRLP40313 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRLP40313 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTRLP40313 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRLP40313 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRLP40313 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRLP40313 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRLP40313 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRLP40313 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTRLP40313 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTRLP40313 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTRLP40313 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTRLP40313 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTRLP40313 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTRLP40313 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTRLP40313 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTRLP40313 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTRLP40313 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTRLP40313 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTRLP40313 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTRLP40313 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTRLP40313 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTRLP40313 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTRLP40313 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTRLP40313 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTRLP40313 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTRLP40313 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTRLP40313 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTRLP40313 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTRLP40313 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTRLP40313 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTRLP40313 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTRLP40313 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTRLP40313 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTRLP40313 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTRLP40313 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTRLP40313 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms