Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTRLP40313 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTRLP40313 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTRLP40313 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTRLP40313 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTRLP40313 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTRLP40313 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRLP40313 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTRLP40313 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTRLP40313 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTRLP40313 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTRLP40313 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTRLP40313 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTRLP40313 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRLP40313 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTRLP40313 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRLP40313 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTRLP40313 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTRLP40313 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTRLP40313 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTRLP40313 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTRLP40313 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTRLP40313 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTRLP40313 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTRLP40313 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTRLP40313 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTRLP40313 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTRLP40313 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTRLP40313 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTRLP40313 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTRLP40313 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTRLP40313 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTRLP40313 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTRLP40313 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTRLP40313 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTRLP40313 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTRLP40313 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTRLP40313 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTRLP40313 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTRLP40313 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTRLP40313 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTRLP40313 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTRLP40313 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTRLP40313 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTRLP40313 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTRLP40313 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRLP40313 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTRLP40313 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRLP40313 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRLP40313 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRLP40313 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRLP40313 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRLP40313 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRLP40313 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTRLP40313 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTRLP40313 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTRLP40313 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTRLP40313 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTRLP40313 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTRLP40313 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTRLP40313 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTRLP40313 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTRLP40313 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTRLP40313 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTRLP40313 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTRLP40313 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTRLP40313 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTRLP40313 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTRLP40313 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTRLP40313 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTRLP40313 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTRLP40313 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRLP40313 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRLP40313 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRLP40313 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTRLP40313 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRLP40313 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRLP40313 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRLP40313 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRLP40313 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRLP40313 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTRLP40313 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTRLP40313 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTRLP40313 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTRLP40313 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRLP40313 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTRLP40313 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTRLP40313 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTRLP40313 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTRLP40313 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRLP40313 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTRLP40313 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRLP40313 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRLP40313 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRLP40313 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTRLP40313 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRLP40313 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRLP40313 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTRLP40313 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTRLP40313 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms