Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HNF1BP35680 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HNF1BP35680 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HNF1BP35680 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HNF1BP35680 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HNF1BP35680 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HNF1BP35680 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HNF1BP35680 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HNF1BP35680 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HNF1BP35680 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HNF1BP35680 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HNF1BP35680 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HNF1BP35680 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HNF1BP35680 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HNF1BP35680 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HNF1BP35680 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HNF1BP35680 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HNF1BP35680 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HNF1BP35680 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HNF1BP35680 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HNF1BP35680 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HNF1BP35680 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HNF1BP35680 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HNF1BP35680 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HNF1BP35680 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HNF1BP35680 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HNF1BP35680 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HNF1BP35680 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HNF1BP35680 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HNF1BP35680 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms