Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RORAP35398 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RORAP35398 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RORAP35398 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RORAP35398 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RORAP35398 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RORAP35398 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RORAP35398 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RORAP35398 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RORAP35398 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RORAP35398 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RORAP35398 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RORAP35398 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RORAP35398 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RORAP35398 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RORAP35398 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RORAP35398 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RORAP35398 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RORAP35398 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RORAP35398 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RORAP35398 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RORAP35398 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RORAP35398 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RORAP35398 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RORAP35398 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RORAP35398 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RORAP35398 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RORAP35398 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RORAP35398 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RORAP35398 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RORAP35398 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RORAP35398 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RORAP35398 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RORAP35398 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RORAP35398 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RORAP35398 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RORAP35398 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RORAP35398 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RORAP35398 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RORAP35398 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RORAP35398 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RORAP35398 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RORAP35398 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RORAP35398 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RORAP35398 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RORAP35398 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RORAP35398 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RORAP35398 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RORAP35398 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RORAP35398 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RORAP35398 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RORAP35398 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RORAP35398 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RORAP35398 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RORAP35398 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RORAP35398 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RORAP35398 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RORAP35398 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RORAP35398 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RORAP35398 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RORAP35398 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RORAP35398 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RORAP35398 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RORAP35398 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RORAP35398 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RORAP35398 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RORAP35398 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RORAP35398 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RORAP35398 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RORAP35398 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RORAP35398 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RORAP35398 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RORAP35398 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RORAP35398 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RORAP35398 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RORAP35398 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RORAP35398 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RORAP35398 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RORAP35398 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RORAP35398 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RORAP35398 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RORAP35398 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RORAP35398 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RORAP35398 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RORAP35398 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RORAP35398 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RORAP35398 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RORAP35398 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RORAP35398 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RORAP35398 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RORAP35398 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RORAP35398 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RORAP35398 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RORAP35398 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms