Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GBP1P32455 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP1P32455 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP1P32455 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP1P32455 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GBP1P32455 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP1P32455 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP1P32455 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP1P32455 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP1P32455 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP1P32455 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP1P32455 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP1P32455 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GBP1P32455 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GBP1P32455 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GBP1P32455 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GBP1P32455 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP1P32455 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP1P32455 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP1P32455 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP1P32455 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP1P32455 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP1P32455 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP1P32455 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP1P32455 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP1P32455 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP1P32455 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP1P32455 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP1P32455 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP1P32455 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP1P32455 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP1P32455 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP1P32455 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP1P32455 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GBP1P32455 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP1P32455 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP1P32455 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP1P32455 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP1P32455 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP1P32455 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP1P32455 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP1P32455 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GBP1P32455 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP1P32455 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP1P32455 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP1P32455 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP1P32455 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP1P32455 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP1P32455 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP1P32455 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP1P32455 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP1P32455 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP1P32455 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP1P32455 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP1P32455 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP1P32455 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP1P32455 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP1P32455 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP1P32455 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP1P32455 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP1P32455 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GBP1P32455 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP1P32455 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GBP1P32455 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GBP1P32455 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP1P32455 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP1P32455 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP1P32455 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GBP1P32455 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP1P32455 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP1P32455 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP1P32455 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP1P32455 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP1P32455 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP1P32455 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP1P32455 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP1P32455 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP1P32455 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP1P32455 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP1P32455 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP1P32455 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GBP1P32455 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GBP1P32455 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP1P32455 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP1P32455 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GBP1P32455 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GBP1P32455 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GBP1P32455 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GBP1P32455 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP1P32455 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP1P32455 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP1P32455 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GBP1P32455 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GBP1P32455 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GBP1P32455 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GBP1P32455 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GBP1P32455 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP1P32455 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP1P32455 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GBP1P32455 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms