Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALDH4A1P30038 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH4A1P30038 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms