Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
KDM5AP29375 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
KDM5AP29375 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
KDM5AP29375 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5AP29375 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
KDM5AP29375 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
KDM5AP29375 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
KDM5AP29375 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
KDM5AP29375 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
KDM5AP29375 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
KDM5AP29375 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
KDM5AP29375 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
KDM5AP29375 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.91■■■■■ 4.14
KDM5AP29375 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
KDM5AP29375 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.14
KDM5AP29375 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
KDM5AP29375 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
KDM5AP29375 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
KDM5AP29375 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
KDM5AP29375 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
KDM5AP29375 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM5AP29375 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
KDM5AP29375 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
KDM5AP29375 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
KDM5AP29375 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
KDM5AP29375 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
KDM5AP29375 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
KDM5AP29375 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
KDM5AP29375 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM5AP29375 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
KDM5AP29375 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM5AP29375 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
KDM5AP29375 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM5AP29375 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5AP29375 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM5AP29375 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5AP29375 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5AP29375 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
KDM5AP29375 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM5AP29375 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM5AP29375 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KDM5AP29375 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5AP29375 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM5AP29375 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM5AP29375 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KDM5AP29375 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5AP29375 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5AP29375 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KDM5AP29375 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
KDM5AP29375 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5AP29375 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5AP29375 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5AP29375 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
KDM5AP29375 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5AP29375 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5AP29375 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5AP29375 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5AP29375 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5AP29375 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5AP29375 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5AP29375 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5AP29375 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
KDM5AP29375 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
KDM5AP29375 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms