Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRABP2P29373 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRABP2P29373 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRABP2P29373 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRABP2P29373 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRABP2P29373 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRABP2P29373 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRABP2P29373 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRABP2P29373 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRABP2P29373 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CRABP2P29373 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CRABP2P29373 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRABP2P29373 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRABP2P29373 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRABP2P29373 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRABP2P29373 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRABP2P29373 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRABP2P29373 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRABP2P29373 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRABP2P29373 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRABP2P29373 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRABP2P29373 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRABP2P29373 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRABP2P29373 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRABP2P29373 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRABP2P29373 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRABP2P29373 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRABP2P29373 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRABP2P29373 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRABP2P29373 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRABP2P29373 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms