Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACKR3P25106 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR3P25106 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR3P25106 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACKR3P25106 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACKR3P25106 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR3P25106 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR3P25106 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACKR3P25106 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR3P25106 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR3P25106 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms