Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTAFRP25105 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTAFRP25105 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTAFRP25105 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTAFRP25105 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTAFRP25105 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAFRP25105 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAFRP25105 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTAFRP25105 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTAFRP25105 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTAFRP25105 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTAFRP25105 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTAFRP25105 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms