Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF4P23510 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF4P23510 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF4P23510 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF4P23510 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF4P23510 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF4P23510 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF4P23510 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF4P23510 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms