Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PTPRGP23470 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
PTPRGP23470 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
PTPRGP23470 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
PTPRGP23470 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
PTPRGP23470 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
PTPRGP23470 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
PTPRGP23470 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
PTPRGP23470 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
PTPRGP23470 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PTPRGP23470 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
PTPRGP23470 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PTPRGP23470 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PTPRGP23470 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PTPRGP23470 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
PTPRGP23470 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PTPRGP23470 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PTPRGP23470 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PTPRGP23470 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRGP23470 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
PTPRGP23470 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
PTPRGP23470 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
PTPRGP23470 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
PTPRGP23470 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
PTPRGP23470 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
PTPRGP23470 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
PTPRGP23470 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
PTPRGP23470 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PTPRGP23470 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
PTPRGP23470 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
PTPRGP23470 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PTPRGP23470 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
PTPRGP23470 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
PTPRGP23470 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
PTPRGP23470 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
PTPRGP23470 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
PTPRGP23470 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
PTPRGP23470 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
PTPRGP23470 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
PTPRGP23470 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
PTPRGP23470 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
PTPRGP23470 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
PTPRGP23470 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
PTPRGP23470 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
PTPRGP23470 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
PTPRGP23470 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
PTPRGP23470 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
PTPRGP23470 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.76
PTPRGP23470 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PTPRGP23470 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
PTPRGP23470 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PTPRGP23470 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
PTPRGP23470 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
PTPRGP23470 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
PTPRGP23470 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
PTPRGP23470 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
PTPRGP23470 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PTPRGP23470 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
PTPRGP23470 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
PTPRGP23470 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
PTPRGP23470 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
PTPRGP23470 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PTPRGP23470 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PTPRGP23470 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44.47■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
PTPRGP23470 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
PTPRGP23470 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PTPRGP23470 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PTPRGP23470 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
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