Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCEA1P23193 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEA1P23193 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEA1P23193 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCEA1P23193 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCEA1P23193 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCEA1P23193 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCEA1P23193 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCEA1P23193 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA1P23193 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA1P23193 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCEA1P23193 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEA1P23193 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA1P23193 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA1P23193 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms