Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKACBP22694 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKACBP22694 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKACBP22694 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKACBP22694 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKACBP22694 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKACBP22694 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKACBP22694 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms