Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NME2P22392 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME2P22392 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME2P22392 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME2P22392 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME2P22392 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME2P22392 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME2P22392 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME2P22392 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME2P22392 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME2P22392 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME2P22392 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME2P22392 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME2P22392 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME2P22392 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME2P22392 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME2P22392 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NME2P22392 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME2P22392 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME2P22392 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME2P22392 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME2P22392 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NME2P22392 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME2P22392 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME2P22392 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME2P22392 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME2P22392 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME2P22392 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NME2P22392 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME2P22392 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME2P22392 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME2P22392 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME2P22392 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME2P22392 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME2P22392 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME2P22392 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME2P22392 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME2P22392 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME2P22392 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME2P22392 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME2P22392 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME2P22392 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME2P22392 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME2P22392 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME2P22392 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME2P22392 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME2P22392 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME2P22392 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME2P22392 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME2P22392 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NME2P22392 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME2P22392 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME2P22392 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME2P22392 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME2P22392 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME2P22392 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME2P22392 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME2P22392 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NME2P22392 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME2P22392 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME2P22392 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NME2P22392 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME2P22392 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME2P22392 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME2P22392 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NME2P22392 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME2P22392 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME2P22392 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME2P22392 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME2P22392 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME2P22392 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME2P22392 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME2P22392 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME2P22392 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME2P22392 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME2P22392 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME2P22392 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME2P22392 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME2P22392 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME2P22392 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME2P22392 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME2P22392 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME2P22392 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NME2P22392 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME2P22392 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME2P22392 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME2P22392 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NME2P22392 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME2P22392 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME2P22392 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NME2P22392 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME2P22392 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME2P22392 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME2P22392 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME2P22392 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME2P22392 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME2P22392 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME2P22392 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME2P22392 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME2P22392 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms