Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH3P22223 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH3P22223 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH3P22223 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH3P22223 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH3P22223 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH3P22223 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH3P22223 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH3P22223 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH3P22223 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH3P22223 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH3P22223 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH3P22223 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH3P22223 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH3P22223 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH3P22223 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH3P22223 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH3P22223 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH3P22223 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH3P22223 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH3P22223 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH3P22223 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH3P22223 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH3P22223 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH3P22223 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH3P22223 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH3P22223 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH3P22223 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH3P22223 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH3P22223 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH3P22223 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH3P22223 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH3P22223 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDH3P22223 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH3P22223 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH3P22223 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH3P22223 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH3P22223 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH3P22223 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH3P22223 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH3P22223 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH3P22223 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH3P22223 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH3P22223 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH3P22223 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH3P22223 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH3P22223 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH3P22223 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH3P22223 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH3P22223 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH3P22223 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH3P22223 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH3P22223 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH3P22223 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH3P22223 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH3P22223 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH3P22223 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH3P22223 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH3P22223 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH3P22223 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH3P22223 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH3P22223 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH3P22223 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH3P22223 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH3P22223 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH3P22223 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH3P22223 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH3P22223 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH3P22223 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH3P22223 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH3P22223 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH3P22223 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH3P22223 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH3P22223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDH3P22223 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDH3P22223 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH3P22223 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH3P22223 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH3P22223 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH3P22223 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH3P22223 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH3P22223 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH3P22223 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH3P22223 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH3P22223 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH3P22223 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CDH3P22223 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH3P22223 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH3P22223 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH3P22223 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH3P22223 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH3P22223 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH3P22223 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH3P22223 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH3P22223 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH3P22223 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH3P22223 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH3P22223 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH3P22223 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH3P22223 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms