Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD247P20963 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD247P20963 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD247P20963 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD247P20963 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD247P20963 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD247P20963 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD247P20963 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD247P20963 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD247P20963 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD247P20963 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD247P20963 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD247P20963 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD247P20963 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD247P20963 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD247P20963 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD247P20963 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD247P20963 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD247P20963 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD247P20963 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD247P20963 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD247P20963 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD247P20963 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD247P20963 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CD247P20963 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD247P20963 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD247P20963 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD247P20963 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD247P20963 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CD247P20963 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD247P20963 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD247P20963 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD247P20963 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD247P20963 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD247P20963 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD247P20963 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD247P20963 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD247P20963 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD247P20963 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD247P20963 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD247P20963 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD247P20963 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD247P20963 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD247P20963 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD247P20963 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD247P20963 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD247P20963 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD247P20963 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD247P20963 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD247P20963 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD247P20963 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD247P20963 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD247P20963 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD247P20963 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD247P20963 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD247P20963 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD247P20963 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD247P20963 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD247P20963 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD247P20963 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CD247P20963 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD247P20963 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD247P20963 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CD247P20963 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD247P20963 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD247P20963 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD247P20963 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD247P20963 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD247P20963 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD247P20963 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD247P20963 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD247P20963 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD247P20963 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD247P20963 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD247P20963 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD247P20963 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD247P20963 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD247P20963 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD247P20963 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD247P20963 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD247P20963 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD247P20963 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD247P20963 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CD247P20963 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD247P20963 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD247P20963 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD247P20963 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD247P20963 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD247P20963 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD247P20963 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD247P20963 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD247P20963 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD247P20963 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD247P20963 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD247P20963 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD247P20963 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD247P20963 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD247P20963 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD247P20963 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD247P20963 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms