Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF3P20783 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF3P20783 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF3P20783 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF3P20783 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF3P20783 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF3P20783 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF3P20783 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF3P20783 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF3P20783 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF3P20783 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF3P20783 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF3P20783 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF3P20783 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF3P20783 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF3P20783 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF3P20783 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF3P20783 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTF3P20783 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTF3P20783 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF3P20783 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF3P20783 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF3P20783 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF3P20783 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF3P20783 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTF3P20783 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTF3P20783 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTF3P20783 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTF3P20783 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTF3P20783 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTF3P20783 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTF3P20783 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTF3P20783 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTF3P20783 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTF3P20783 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTF3P20783 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTF3P20783 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTF3P20783 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTF3P20783 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTF3P20783 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTF3P20783 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NTF3P20783 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NTF3P20783 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTF3P20783 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTF3P20783 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTF3P20783 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTF3P20783 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NTF3P20783 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTF3P20783 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTF3P20783 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTF3P20783 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTF3P20783 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTF3P20783 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NTF3P20783 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTF3P20783 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTF3P20783 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTF3P20783 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTF3P20783 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTF3P20783 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTF3P20783 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTF3P20783 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTF3P20783 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTF3P20783 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTF3P20783 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTF3P20783 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTF3P20783 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTF3P20783 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTF3P20783 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTF3P20783 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTF3P20783 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTF3P20783 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTF3P20783 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTF3P20783 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTF3P20783 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTF3P20783 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTF3P20783 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTF3P20783 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTF3P20783 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTF3P20783 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTF3P20783 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTF3P20783 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTF3P20783 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTF3P20783 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTF3P20783 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTF3P20783 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTF3P20783 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTF3P20783 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTF3P20783 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NTF3P20783 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTF3P20783 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTF3P20783 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTF3P20783 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF3P20783 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF3P20783 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF3P20783 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF3P20783 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF3P20783 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF3P20783 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF3P20783 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF3P20783 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms