Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMY2BP19961 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMY2BP19961 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMY2BP19961 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMY2BP19961 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMY2BP19961 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMY2BP19961 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMY2BP19961 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMY2BP19961 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms