Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD58P19256 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD58P19256 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD58P19256 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD58P19256 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD58P19256 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD58P19256 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD58P19256 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD58P19256 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CD58P19256 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD58P19256 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD58P19256 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD58P19256 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD58P19256 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD58P19256 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD58P19256 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD58P19256 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD58P19256 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD58P19256 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD58P19256 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD58P19256 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD58P19256 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD58P19256 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD58P19256 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD58P19256 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD58P19256 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD58P19256 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD58P19256 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD58P19256 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD58P19256 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD58P19256 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD58P19256 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD58P19256 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD58P19256 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD58P19256 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD58P19256 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD58P19256 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CD58P19256 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CD58P19256 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD58P19256 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD58P19256 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD58P19256 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD58P19256 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD58P19256 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD58P19256 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD58P19256 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD58P19256 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD58P19256 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD58P19256 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD58P19256 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD58P19256 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD58P19256 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD58P19256 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD58P19256 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD58P19256 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD58P19256 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD58P19256 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CD58P19256 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD58P19256 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD58P19256 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD58P19256 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD58P19256 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD58P19256 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD58P19256 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD58P19256 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD58P19256 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD58P19256 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD58P19256 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CD58P19256 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD58P19256 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD58P19256 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CD58P19256 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD58P19256 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD58P19256 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD58P19256 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD58P19256 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD58P19256 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD58P19256 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CD58P19256 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD58P19256 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD58P19256 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD58P19256 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD58P19256 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD58P19256 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD58P19256 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CD58P19256 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD58P19256 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD58P19256 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD58P19256 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD58P19256 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD58P19256 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD58P19256 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD58P19256 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD58P19256 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD58P19256 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD58P19256 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CD58P19256 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD58P19256 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD58P19256 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD58P19256 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms