Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMD1P17707 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMD1P17707 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMD1P17707 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMD1P17707 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMD1P17707 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AMD1P17707 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AMD1P17707 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AMD1P17707 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AMD1P17707 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AMD1P17707 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AMD1P17707 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AMD1P17707 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMD1P17707 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMD1P17707 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMD1P17707 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AMD1P17707 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AMD1P17707 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMD1P17707 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMD1P17707 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMD1P17707 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMD1P17707 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMD1P17707 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMD1P17707 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMD1P17707 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMD1P17707 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMD1P17707 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMD1P17707 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMD1P17707 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMD1P17707 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMD1P17707 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMD1P17707 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMD1P17707 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMD1P17707 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMD1P17707 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMD1P17707 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMD1P17707 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMD1P17707 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AMD1P17707 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMD1P17707 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMD1P17707 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMD1P17707 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMD1P17707 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AMD1P17707 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMD1P17707 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AMD1P17707 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMD1P17707 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMD1P17707 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMD1P17707 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMD1P17707 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AMD1P17707 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMD1P17707 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMD1P17707 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMD1P17707 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMD1P17707 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMD1P17707 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMD1P17707 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMD1P17707 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AMD1P17707 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AMD1P17707 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AMD1P17707 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AMD1P17707 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AMD1P17707 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMD1P17707 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMD1P17707 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMD1P17707 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AMD1P17707 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AMD1P17707 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AMD1P17707 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMD1P17707 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AMD1P17707 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
AMD1P17707 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMD1P17707 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMD1P17707 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMD1P17707 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMD1P17707 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AMD1P17707 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMD1P17707 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMD1P17707 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AMD1P17707 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMD1P17707 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMD1P17707 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMD1P17707 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMD1P17707 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMD1P17707 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMD1P17707 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMD1P17707 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMD1P17707 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMD1P17707 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMD1P17707 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMD1P17707 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMD1P17707 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMD1P17707 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMD1P17707 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMD1P17707 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AMD1P17707 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMD1P17707 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMD1P17707 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMD1P17707 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMD1P17707 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms