Protein–RNA interactions for Protein: P16298

PPP3CB, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CBP16298 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CBP16298 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CBP16298 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP3CBP16298 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP3CBP16298 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CBP16298 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CBP16298 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP3CBP16298 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CBP16298 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CBP16298 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP3CBP16298 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP3CBP16298 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP3CBP16298 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP3CBP16298 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CBP16298 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CBP16298 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms