Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFTPCP11686 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFTPCP11686 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFTPCP11686 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFTPCP11686 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFTPCP11686 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFTPCP11686 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFTPCP11686 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFTPCP11686 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFTPCP11686 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFTPCP11686 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFTPCP11686 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFTPCP11686 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SFTPCP11686 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SFTPCP11686 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SFTPCP11686 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFTPCP11686 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFTPCP11686 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFTPCP11686 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFTPCP11686 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFTPCP11686 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFTPCP11686 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFTPCP11686 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPCP11686 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPCP11686 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPCP11686 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFTPCP11686 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFTPCP11686 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFTPCP11686 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFTPCP11686 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFTPCP11686 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFTPCP11686 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFTPCP11686 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFTPCP11686 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFTPCP11686 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFTPCP11686 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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