Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
MMP10P09238 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MMP10P09238 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MMP10P09238 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MMP10P09238 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MMP10P09238 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
MMP10P09238 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MMP10P09238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MMP10P09238 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
MMP10P09238 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MMP10P09238 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MMP10P09238 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
MMP10P09238 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MMP10P09238 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MMP10P09238 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MMP10P09238 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MMP10P09238 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MMP10P09238 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
MMP10P09238 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
MMP10P09238 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MMP10P09238 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
MMP10P09238 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MMP10P09238 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MMP10P09238 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MMP10P09238 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
MMP10P09238 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MMP10P09238 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MMP10P09238 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MMP10P09238 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MMP10P09238 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MMP10P09238 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
MMP10P09238 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MMP10P09238 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MMP10P09238 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MMP10P09238 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MMP10P09238 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
MMP10P09238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
MMP10P09238 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MMP10P09238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
MMP10P09238 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MMP10P09238 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MMP10P09238 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MMP10P09238 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MMP10P09238 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MMP10P09238 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
MMP10P09238 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MMP10P09238 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MMP10P09238 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
MMP10P09238 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
MMP10P09238 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
MMP10P09238 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MMP10P09238 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MMP10P09238 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MMP10P09238 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MMP10P09238 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
MMP10P09238 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
MMP10P09238 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MMP10P09238 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MMP10P09238 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MMP10P09238 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MMP10P09238 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MMP10P09238 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MMP10P09238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MMP10P09238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MMP10P09238 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MMP10P09238 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MMP10P09238 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
MMP10P09238 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MMP10P09238 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MMP10P09238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MMP10P09238 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MMP10P09238 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MMP10P09238 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MMP10P09238 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MMP10P09238 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MMP10P09238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MMP10P09238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MMP10P09238 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MMP10P09238 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MMP10P09238 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MMP10P09238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MMP10P09238 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MMP10P09238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MMP10P09238 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MMP10P09238 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MMP10P09238 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MMP10P09238 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MMP10P09238 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MMP10P09238 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MMP10P09238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MMP10P09238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MMP10P09238 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MMP10P09238 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
MMP10P09238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
MMP10P09238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
MMP10P09238 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MMP10P09238 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MMP10P09238 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MMP10P09238 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MMP10P09238 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms