Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD3P08294 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOD3P08294 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOD3P08294 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOD3P08294 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD3P08294 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD3P08294 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD3P08294 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SOD3P08294 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD3P08294 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD3P08294 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SOD3P08294 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD3P08294 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD3P08294 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD3P08294 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOD3P08294 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD3P08294 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOD3P08294 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOD3P08294 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOD3P08294 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOD3P08294 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOD3P08294 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SOD3P08294 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOD3P08294 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOD3P08294 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOD3P08294 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOD3P08294 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOD3P08294 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOD3P08294 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOD3P08294 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOD3P08294 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOD3P08294 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOD3P08294 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOD3P08294 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOD3P08294 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOD3P08294 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOD3P08294 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOD3P08294 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOD3P08294 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOD3P08294 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOD3P08294 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOD3P08294 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOD3P08294 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOD3P08294 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOD3P08294 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOD3P08294 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOD3P08294 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SOD3P08294 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOD3P08294 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOD3P08294 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOD3P08294 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOD3P08294 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOD3P08294 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOD3P08294 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOD3P08294 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOD3P08294 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOD3P08294 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOD3P08294 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOD3P08294 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOD3P08294 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOD3P08294 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOD3P08294 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOD3P08294 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOD3P08294 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOD3P08294 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOD3P08294 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOD3P08294 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOD3P08294 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOD3P08294 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD3P08294 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD3P08294 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD3P08294 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD3P08294 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOD3P08294 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD3P08294 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD3P08294 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD3P08294 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD3P08294 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD3P08294 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD3P08294 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD3P08294 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOD3P08294 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD3P08294 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD3P08294 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD3P08294 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD3P08294 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD3P08294 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD3P08294 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD3P08294 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD3P08294 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD3P08294 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD3P08294 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD3P08294 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD3P08294 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD3P08294 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD3P08294 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD3P08294 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD3P08294 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOD3P08294 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOD3P08294 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms