Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LDHCP07864 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LDHCP07864 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LDHCP07864 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LDHCP07864 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LDHCP07864 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LDHCP07864 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LDHCP07864 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LDHCP07864 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LDHCP07864 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LDHCP07864 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LDHCP07864 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LDHCP07864 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LDHCP07864 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LDHCP07864 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LDHCP07864 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LDHCP07864 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LDHCP07864 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LDHCP07864 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LDHCP07864 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LDHCP07864 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LDHCP07864 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LDHCP07864 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LDHCP07864 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LDHCP07864 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LDHCP07864 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LDHCP07864 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LDHCP07864 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LDHCP07864 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LDHCP07864 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LDHCP07864 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LDHCP07864 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LDHCP07864 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LDHCP07864 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LDHCP07864 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LDHCP07864 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LDHCP07864 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LDHCP07864 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LDHCP07864 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LDHCP07864 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LDHCP07864 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LDHCP07864 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LDHCP07864 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LDHCP07864 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LDHCP07864 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LDHCP07864 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LDHCP07864 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LDHCP07864 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LDHCP07864 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LDHCP07864 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LDHCP07864 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LDHCP07864 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LDHCP07864 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LDHCP07864 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LDHCP07864 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LDHCP07864 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LDHCP07864 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LDHCP07864 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LDHCP07864 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
LDHCP07864 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LDHCP07864 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LDHCP07864 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LDHCP07864 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LDHCP07864 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LDHCP07864 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LDHCP07864 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LDHCP07864 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LDHCP07864 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LDHCP07864 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LDHCP07864 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LDHCP07864 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LDHCP07864 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LDHCP07864 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LDHCP07864 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LDHCP07864 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LDHCP07864 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LDHCP07864 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LDHCP07864 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LDHCP07864 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LDHCP07864 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LDHCP07864 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LDHCP07864 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LDHCP07864 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LDHCP07864 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LDHCP07864 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LDHCP07864 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LDHCP07864 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LDHCP07864 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
LDHCP07864 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LDHCP07864 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
LDHCP07864 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LDHCP07864 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
LDHCP07864 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LDHCP07864 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LDHCP07864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LDHCP07864 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LDHCP07864 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LDHCP07864 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LDHCP07864 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LDHCP07864 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms